התהליך כולל ארבעה שלבים עיקריים

1. פניה לקהילה היהודית בפורטוגל לטובת קבלת אישור על שייכות לקהילה יהודית ספרדית בפורטוגל. על בסיס אישור זה תוגש בקשת האזרחות.

2. הגשת בקשת האזרחות לממשלת פורטוגל.

3. בחינת הבקשה.

4. הנפקת תעודת אזרח ודרכון.

שלב ראשון - פניה לקהילה היהודית

הפניה לקהילה היהודית כוללת בין הייתר הוכחת זיקה למגורשי ספרד פורטוגל. כל יהודי ברחבי העולם אשר יכול להוכיח קשר משפחתי למגורשי ספרד פורטוגל, זכאי לקבל אזרחות פורטוגלית המקנה דרכון פורטוגלי אירופאי. הוכחת הזיקה מתבטאת בין הייתר בהוכחת קשר לאחת המדינות אליהן היגרו יהודים לאחר גירוש ספרד פורטוגל. כמו - טורקיה, יוון, מדינות הבלקן, מרוקו, לוב, טוניסיה, אלג'יריה, מצרים, בולגריה, סוריה, לבנון, עירק, מדינות דרום אמריקה ועוד.

הדרכים להוכחת הזיקה והזכאות מגוונות. אחת מהן היא להוכיח באמצעות תעודה כל שהיא ממדינת המקור. לדוגמא - סבתא שנולדה בטורקיה, והמשפחה מחזיקה בתעודת הלידה המקורית, דרכון, תעודת זהות, תעודת נישואין או בכל תמונה או מסמך אחר ממדינת המקור. ככל שלא קיימים במשפחה מסמכים שכאלה, ניתן להמציא תעודת תמצית רישום ממשרד הפנים, בה רשומה ארץ הלידה. לעיתים ארץ הלידה מופיעה גם בתעודת הזהות. 

יש להשלים את המסמכים הנדרשים על ידי הקהילה היהודית, לרבות עץ משפחה מפורט, לטובת קבלת אישור הקהילה על בסיסו תוגש בקשת האזרחות. אישור הקהילה העקרוני מתקבל מהר מאוד (לאחר שליחת כל המסמכים הנדרשים). לאחר קבלת האישור העקרוני, יונפק אישור הקהילה הרשמי. זאת לאחר כחמישה שבועות בערך ממועד תשלום אגרת הקהילה והשלמת ייתר המסמכים הנדרשים להנפקתו.

שלב רביעי - הנפקת תעודת אזרח ודרכון

לאחר קבלת תעודת הלידה ניתן יהיה להוציא את תעודת האזרח והדרכון בשגרירות פורטוגל בישראל או במדינת פורטוגל.